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Technical articles赛默飞(Thermo Fisher)实时荧光定量PCR仪是现代分子生物学中常用的分析工具之一,其广泛应用于基因表达分析、病原检测、突变检测等研究领域。特别是其7500型实时荧光定量PCR仪(Applied Biosystems 7500 Real-Time PCR System),以其精确的温控系统、灵敏的荧光信号检测能力、以及用户友好的操作界面,成为许多实验室的设备。以下是关于7500型实时荧光定量PCR仪的详细使用步骤和原理说明。
实时荧光定量PCR(qPCR)是一种高灵敏度的基因扩增技术,通过荧光信号监测PCR反应过程中的DNA扩增。其基本原理是在PCR反应中加入带有荧光标签的探针或染料,通过实时检测荧光信号的变化,推测出目标DNA的初始数量。与传统PCR不同,实时PCR能够在PCR扩增过程中实时监测产物的数量,因此可以获得更为精准的定量数据。
赛默飞7500型PCR仪采用先进的光学检测系统和精密的温控系统,能够提供高度精确的实验数据。其主要特点包括:
多通道荧光检测:7500型仪器具有多达6个荧光通道,支持不同荧光探针或染料的同时检测,适用于多重PCR反应。
高效的热循环系统:仪器采用精密的热循环技术,温控精度和均匀性较高,能够确保扩增反应的高效进行。
用户友好的操作界面:7500型PCR仪配备大尺寸触摸屏,操作界面直观,支持数据实时显示、分析与报告生成。
在使用7500型实时荧光定量PCR仪之前,首先需要完成设备的安装和调试工作。这些步骤包括:
位置选择:选择一个稳定、无强电磁干扰和温度波动的地方来放置PCR仪器。避免直射阳光和震动,确保设备的稳定性。
设备连接:连接电源线、计算机(如果需要)和网络(如有需要)。确保所有连接无松动。
打开设备电源,设备会自动进行自检。此过程是为了确保硬件系统的正常运作,检查如热循环系统、荧光检测系统等关键部件。
检查液晶屏是否正常显示,仪器是否能够顺利进入操作界面。
DNA模板:提取所需的DNA模板,通常需要在PCR前进行核酸纯化,确保模板的纯度和浓度适合实验要求。
引物和探针:根据实验目的设计特异性的引物和探针。设计时需注意引物的长度、GC含量、退火温度等因素,以确保引物的特异性和扩增效率。
PCR反应混合物:PCR反应体系一般包括模板DNA、引物、探针、荧光染料(如SYBR Green或TaqMan探针)、PCR缓冲液、dNTPs、DNA聚合酶等。需要根据具体的实验要求调整反应体系的组成。
按照试剂盒说明书或实验设计配制PCR反应液,保证每个反应孔中加入合适量的反应液和模板。
一般来说,反应液的总量可以根据实验设计设置,通常每个反应孔的体积为20-50 μL。
将配制好的反应混合物和模板按实验设计分配到PCR板的各个孔中。确保每个孔的液体量一致,并且避免产生气泡。
样品加载完成后,使用PCR板封膜,确保密封良好。
在7500型PCR仪的触摸屏上,选择“新建实验"选项。根据实验的要求设置反应条件,如扩增循环数、退火温度、荧光通道等。
选择合适的PCR反应体系类型,例如SYBR Green染料体系或TaqMan探针体系。
热启动:大多数PCR反应体系需要在初始阶段进行热启动,以激活DNA聚合酶,避免非特异性扩增。
扩增程序:设置适合的扩增程序,通常包括变性、退火、延伸三个步骤。对于SYBR Green染料体系,通常需要一个较长的退火/延伸时间来确保信号的准确检测。
数据采集:在每个扩增循环结束时,选择荧光信号采集时间点。一般来说,实时PCR仪会在延伸步骤后进行荧光数据的采集。
在确认所有参数设置无误后,点击“开始"启动PCR实验。仪器将根据设置的程序自动进行反应。
在实验过程中,7500型PCR仪会实时显示扩增曲线和荧光数据。用户可以随时查看实验进度和荧光信号变化。
在PCR反应过程中,随着扩增产物的增加,荧光信号逐渐增强。通过荧光信号的阈值设置,可以确定扩增的起始点(Ct值)。
Ct值分析:通过分析不同样品的Ct值,可以确定目标基因的表达量或DNA的初始拷贝数。Ct值越小,表示样品中目标基因的初始浓度越高。
标准曲线:为了定量测定目标基因的相对或绝对表达量,可以使用已知浓度的标准品来建立标准曲线,并通过该曲线来计算样品中目标基因的浓度。
相对定量分析:在基因表达分析中,通常采用2-ΔΔCt法进行相对定量分析。通过比较实验组和对照组的Ct值,可以得出目标基因在不同样本中的相对表达水平。
实验完成后,用户可以通过设备的分析软件导出实验数据并生成报告。报告中包含扩增曲线、Ct值、标准曲线等相关数据。
模板质量:模板的质量直接影响PCR的结果,应确保模板无污染且浓度适中。
引物设计:引物设计不合理可能导致扩增失败或非特异性扩增,因此设计时要保证引物的特异性和二聚体形成的最小化。
反应体系:PCR反应体系需要根据试剂和样品的具体情况进行优化,以提高扩增效率和信号的灵敏度。
无扩增或扩增信号弱:可能是模板量不足、引物设计不合理、PCR条件设置不当等问题导致。应检查模板质量、引物特异性及PCR程序设置。
非特异性扩增:可以通过优化引物退火温度或使用特异性更强的探针来避免非特异性扩增。
荧光信号偏低:可能是染料添加量不足、热循环条件不合适等原因导致。检查荧光染料的浓度和PCR反应条件。
赛默飞7500型实时荧光定量PCR仪以其高精度的温控系统和灵敏的荧光检测能力,广泛应用于基因表达分析、病原检测、基因变异分析等研究领域。通过优化实验条件和合理设计反应体系,研究人员可以获得高质量的定量PCR数据。