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赛默飞荧光定量pcr仪使用方法

发布时间:2024/12/25点击次数:35

赛默飞荧光定量PCR仪使用方法

赛默飞荧光定量PCR仪(如 QuantStudio 系列、ABI 7500 系列)广泛用于基因表达分析、病原体检测、基因分型等实验。以下是荧光定量PCR仪的标准操作方法,帮助您完成实验。


1. 仪器操作前的准备

实验设计

  1. 确定实验目标:

    • 基因表达定量、病原体检测、SNP分析等。

  2. 选择合适的试剂体系:

    • 使用 TaqMan 探针、SYBR Green 染料或其他符合实验需求的反应体系。

实验材料准备

  • 样本模板(如 DNA、RNA 经过反转录的 cDNA)。

  • 引物和探针(设计特异性高的引物和探针)。

  • PCR 反应试剂(如 Taq 酶、dNTPs)。

  • PCR 反应板(96孔或384孔,依仪器型号选择)或 PCR 管。

  • 无菌操作工具(如移液器、滤芯吸头)。

检查仪器状态

  • 确保荧光定量PCR仪已正确连接电源并开机。

  • 检查仪器是否校准,包括光学通道和温控模块。

  • 清洁样本托盘,避免污染。


2. 样本和反应混合物的制备

标准 PCR 反应体系(以 20 µL 反应体系为例):

成分体积(µL)说明
样本模板1-2根据实验需求调整浓度和体积
引物对(10 µM)0.4-1.0每对引物(正向和反向)
探针或染料0.5如 TaqMan 探针或 SYBR Green 染料
PCR 反应缓冲液10含 Mg²⁺、dNTPs 等
Taq DNA 聚合酶0.5热稳定酶,支持实时扩增
无核酸酶水调至总量 20 µL确保反应体系最终体积正确

步骤:

  1. 在无菌环境下混合所有反应成分,轻轻振荡均匀,避免气泡产生。

  2. 将混合好的反应液分装至 96 孔 PCR 板或 0.2 mL PCR 管中。

  3. 在每个孔/管上覆盖光学透明封板或封膜,防止蒸发。

  4. 确保每孔的体积一致,以避免离心过程中不平衡。


3. 荧光定量PCR仪操作步骤

1. 启动仪器

  • 按仪器型号启动,如 QuantStudio 系列或 ABI 7500 系列。

  • 打开仪器配套软件(如 QuantStudio Design and Analysis 软件)。

2. 设置实验参数

  1. 选择实验类型:

    • 绝对定量实验:检测样本中靶基因的绝对拷贝数。

    • 相对定量实验:研究靶基因在不同样本中的表达水平。

    • 溶解曲线分析:用于区分特异性扩增和非特异性扩增产物。

  2. 输入实验设计:

    • 输入靶基因和对照基因的信息。

    • 荧光染料/探针类型(如 FAM、SYBR Green)。

  3. 选择样本板格式:

    • 根据实验需要选择 96 孔板或 384 孔板。

    • 设置每个孔的样本名称、反应成分和靶标信息。

  4. 设置 PCR 程序:

    • 初始变性: 95°C,2 分钟。

    • 循环反应:

    • 95°C,15 秒(变性)。

    • 60°C,30-60 秒(退火和延伸),共 40-45 个循环。

    • 标准热循环程序:

    • 如果是溶解曲线分析,加入升温梯度(如从 60°C 升至 95°C)。

3. 加载样本板

  • 将已封装好的 PCR 板或 PCR 管放入仪器样本托盘。

  • 确保板的摆放位置正确,并关闭样本舱门。

4. 启动运行

  • 点击软件中的 "运行" 按钮,启动实验程序。

  • 仪器开始热循环过程,同时采集荧光信号。


4. 数据分析和结果处理

1. 实时监测

  • 仪器运行期间,可实时观察荧光信号累积曲线,监控样本扩增状态。

2. 结果分析

  • 扩增曲线:分析每个样本的荧光信号累积曲线,判断 Ct 值(循环阈值)。

  • Ct 值分析:

    • 定量分析靶标的表达水平。

    • 样本浓度越高,Ct 值越低。

  • 溶解曲线(SYBR Green 实验):判断扩增产物的特异性。

  • 标准曲线分析(绝对定量实验):根据标准品浓度绘制标准曲线,计算样本浓度。

3. 数据导出

  • 实验完成后,通过软件导出实验数据(如扩增曲线图、Ct 值表)。

  • 数据可保存为 Excel、PDF 或其他格式,方便后续分析。


5. 仪器清洁与维护

  1. 样本舱清洁:

    • 每次实验后,用无尘布轻轻擦拭样本托盘,去除可能的污染物。

    • 定期清洁光学模块(如说明书所示),确保荧光检测灵敏度。

  2. 软件维护:

    • 定期更新仪器和软件至最新版本,获取最新功能和性能优化。

  3. 校准与检测:

    • 定期校准仪器光学系统和温控模块,确保数据准确性。

    • 如果仪器长期未使用,建议在正式实验前进行性能验证。

  4. 安全存储:

    • 关闭仪器电源,保持设备干燥。

    • 防止样本托盘接触过高湿度或灰尘。


注意事项

  1. 样本准备阶段:

    • 严格避免交叉污染。

    • 使用无 RNA 酶、无 DNA 酶的耗材。

    • 模板样本浓度适中,过高会导致抑制扩增。

  2. 反应体系配置:

    • 所有操作在冰上进行,防止酶降解。

    • 确保所有反应组分混合均匀。

  3. 实验运行阶段:

    • 不要随意中断仪器运行,避免影响实验数据。

    • 保证实验室环境稳定,避免震动或电力波动。


总结

赛默飞荧光定量PCR仪的使用主要包括 样本准备、反应体系配置、仪器参数设置、运行程序以及数据分析 等五个核心环节。严格按照操作规范可以有效提高实验的成功率和数据的可靠性。实验完成后,定期维护仪器可确保其长期稳定运行。


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