聚合酶链式反应(PCR)是一种广泛应用于分子生物学、医学诊断、食品安全和环境检测等领域的核酸扩增技术。实时荧光定量PCR(Real-Time Quantitative PCR, qPCR)在传统PCR的基础上引入了荧光探针或染料,使得反应进程可以实时监测。熔解温度(Tm,Melting Temperature)作为核酸双链解链过程中的一个关键参数,能够为引物特异性分析、突变检测、产物鉴别等提供重要依据。
赛默飞科技生产的实时荧光定量PCR仪因其灵敏度、通量和数据分析能力,在多个实验室中得到广泛使用。本文将详细介绍如何利用赛默飞实时荧光定量PCR仪进行Tm值的测定,并探讨该过程的技术原理、实验步骤及其应用价值。
熔解温度(Tm值)是指双链DNA变性为单链时的温度,此时有50%的双链DNA分子解链。Tm值受DNA序列长度、GC含量、离子浓度、DNA浓度等因素影响。测定Tm值对于以下方面具有重要意义:
引物和探针设计优化:确保扩增的特异性和效率。
产物鉴别:通过熔解曲线识别不同的扩增产物或杂交探针的结合差异。
SNP和突变检测:通过微小Tm值差异区分单核苷酸变异。
验证扩增特异性:避免非特异性扩增对结果造成干扰。
赛默飞的实时PCR系统通常采用SYBR Green I或TaqMan探针等荧光标记方式来监测DNA扩增。对于Tm值测定,多采用SYBR Green染料,其在双链DNA存在时发出荧光,单链时荧光迅速降低。通过逐步升温并记录荧光变化,即可绘制出熔解曲线,进一步计算Tm值。
仪器通过以下机制测定Tm值:
荧光信号采集:在升温过程中持续监测SYBR Green的荧光变化。
熔解曲线分析:荧光信号随温度升高而下降,取导数(-dF/dT)后得到Tm峰值。
软件计算与输出:赛默飞的软件可自动识别Tm峰值并输出精确数据。
qPCR Master Mix(含SYBR Green)
引物(Forward/Reverse)
模板DNA
无RNA酶水
组分 | 体积(µL) |
---|---|
SYBR Green Mix | 10 |
上游引物(10 µM) | 0.8 |
下游引物(10 µM) | 0.8 |
模板DNA | 1 |
无RNA酶水 | 7.4 |
总计 | 20 |
全国服务咨询热线
13158823830杭州实了个验生物科技有限公司