在分子生物学研究中,核酸与蛋白质的定量与纯度分析是最基础、也是最关键的实验环节。赛默飞 NanoDrop 系列分光光度计因其超微量检测能力和操作简便性而广受科研人员欢迎。其中,NanoDrop Eight 作为多通道检测设备,能够同时完成八个样品的定量分析,大大提升了实验室的效率。
在使用过程中,科研人员常常需要将 NanoDrop Eight 的检测结果与其他检测方式(如单通道 NanoDrop One、传统比色皿法、荧光定量法等)进行对比,以确认数据的准确性与重复性。本文将系统解析 NanoDrop Eight 的结果特征,并结合多维度对比进行详细说明。
检测原理
基于紫外-可见分光光度法,直接检测样品在 190–850 nm 波段的光吸收。
无需比色皿,使用微量样品(1–2 µL)即可完成定量。
主要性能
同时检测 8 个样品,极大缩短操作时间。
核酸浓度检测范围广(2–15,000 ng/µL)。
蛋白质检测支持 A280 法、BCA、Bradford 等方法。
软件自动计算纯度比值,如 A260/A280、A260/A230。
结果输出
数值结果:浓度、纯度比值。
光谱结果:完整的吸收曲线,便于进一步分析。
NanoDrop Eight 的检测结果主要以以下几种形式呈现:
浓度数值
核酸浓度通过 A260 吸光度换算得出。
蛋白浓度可通过 A280 吸收或其他显色方法。
纯度比值
A260/A280 比值:反映蛋白污染情况。
A260/A230 比值:反映盐离子、酚类污染情况。
吸收光谱曲线
190–850 nm 全波段扫描,呈现峰型与背景情况。
通过光谱曲线可直观判断杂质干扰。
批量数据报告
支持同时导出 8 个样品的结果,以表格或 PDF 报告形式保存。
相同点:
核酸和蛋白浓度的检测原理一致。
数据可靠性和准确性均处于同一水平。
差异点:
通量:NanoDrop Eight 支持 8 通道同步检测,效率高于单通道 NanoDrop One。
适用场景:NanoDrop One 更适合单样品快速检测,NanoDrop Eight 更适合大批量样品分析。
操作体验:Eight 需要配合专用多孔板或探头,而 One 可直接点样。
优势:
样品体积小,1–2 µL 即可检测。
无需稀释,减少人为误差。
检测速度快,数秒即可得到结果。
不足:
对高浓度样品可能需稀释,否则吸光度超出线性范围。
NanoDrop Eight:
通过光吸收直接测定浓度,操作简单,快速出结果。
对污染较敏感,A260/A280 或 A260/A230 偏离标准值时,需谨慎解读。
荧光定量法:
灵敏度高,可检测低至 0.1 ng/µL 的核酸。
对杂质不敏感,但需耗材和特定染料。
结论:
NanoDrop Eight 更适合常规浓度范围的快速检测。
荧光定量更适合痕量样品或高精度需求。
NanoDrop 2000/2000c:功能稳定,但仅支持单样品检测。
NanoDrop 3300:主要用于荧光检测,与 Eight 的 UV-Vis 模式不同。
NanoDrop Eight:优势在于高通量和快速出结果,适合高效实验室环境。
需求:检测质粒 DNA 浓度与纯度。
结果对比:
NanoDrop Eight 与 NanoDrop One 测得浓度一致性较高,差异小于 3%。
与比色皿法相比,Eight 检测更快,且样品消耗量更小。
需求:检测 RNA 纯度,避免蛋白或盐类污染。
结果对比:
NanoDrop Eight 的 A260/A280 与 A260/A230 结果与 NanoDrop One 基本一致。
若使用荧光法测定,浓度可能略低,因为荧光法仅检测完整 RNA,不包括降解片段。
需求:检测蛋白浓度,评估纯化效果。
结果对比:
A280 法在 NanoDrop Eight 与 NanoDrop One 上差异极小。
若采用 Bradford 显色法,需额外试剂,与 UV 法结果略有差别。
需求:对环境水样中 DNA、蛋白或杂质进行分析。
结果对比:
NanoDrop Eight 光谱曲线可揭示背景干扰峰,比单点检测更直观。
在复杂样品中,荧光法往往得出更低的有效浓度。
样品处理不一致
移液操作误差、混匀不足导致结果差异。
仪器差异
光路设计不同可能导致微小偏差。
检测原理差异
UV 吸收法与荧光法关注的分子状态不同,结果不可完全对等。
样品杂质干扰
蛋白、酚类、盐离子可能导致比值异常。
A260/A280 偏低
说明样品存在蛋白污染,可进一步纯化。
A260/A230 偏低
提示盐类或有机溶剂残留,需重新纯化。
不同设备结果不一致
检查样品均一性,保证各平台取样一致。
重复性差
建议用同一移液器、同一人员操作,减少人为误差。
通过对比,NanoDrop Eight 的结果在数值准确性、重复性和与其他设备的相关性方面均表现优异,适合高通量核酸和蛋白定量分析。其主要优势在于:
检测效率高:同时检测 8 个样品,适合大规模实验。
操作简便:无需比色皿,样品用量少。
结果直观:同时输出数值与光谱,便于全面评估。
不足之处在于对痕量样品不够敏感,对于低于 2 ng/µL 的核酸需借助荧光定量法。
NanoDrop Eight 作为赛默飞 NanoDrop 系列的高通量版本,在核酸和蛋白定量分析中具有显著优势。通过与 NanoDrop One、传统比色皿法以及荧光法的结果对比,可以看出:
在常规浓度范围内,NanoDrop Eight 与其他方法结果高度一致。
在痕量检测与污染敏感性方面,结果可能存在差异,需要结合具体实验需求选择方法。
其独特的多通道优势,使其在需要批量处理样品的分子生物学与医药研发实验室中具备不可替代的地位。
通过科学合理地理解和比较检测结果,科研人员可以更有效地利用 NanoDrop Eight,为实验提供可靠的数据支持。
杭州实了个验生物科技有限公司